При перепроведение документа проводка каждый раз увеличивается на сумму проводки с нарастающим итогом: удваиваются, утраиваются и так далее. Почему ?
Вероятнее всего что в режиме "Конфигуратор" в свойствах документа была убрана галочка в Автоматическое удаление движений", тогда в этом случае новая проводка добавляется, а старая к сожалению не удаляется. Поставь галочку, сохрани конфигурацию и перепроведи документ и все будет нормально.